Após os acontecimentos do filme, Duke e Scarlett viaja para o Ártico e livre Heavy Duty, e Ripcord Snake Eyes do Centro de Detenção MARS. Além disso, eles lutam a baronesa e trazê-la à cova. No Egito, o Joes Cobra saber que está levando a Apep (Gem). Na selva, o Joes Cobra saber que está fazendo um edifício em forma de pirâmide, no meio da selva. De lá, o Joes deve derrotar James McCullen (que agora assume a identidade do Destro) no terraço do prédio da pirâmide. Finalmente, deve derrotar o Comandante Cobra e Storm Shadow na base pólo magnético norte do vulcão. Entre as classes incluídas para os vários personagens em The Rise of Cobra incluem Commando que fazem bem de perto, Heavy Weapons que possuem habilidades extraordinárias mas fazer o melhor tiro de uma distância e Soldier que são um equilíbrio entre os dois. clássico "Yo Joe!" grito de guerra está em jogo, sendo usado como uma invulnerabilidade power-up quando o GI personagem Joe ganha acesso a Armadura do acelerador, permitindo-lhes para não serem danificados durante Cobra atacando as tropas e veículos.

O jogo recebeu a pontuação negativa mista de um monte de sites. Atingiu uma média Metacritic de 42% sobre o Xbox 360, e 43% em relação ao PS3.

IGN deu á console principal uma versão [5.8 / 10], criticando gráficos pobres do jogo e do jogo em geral. IGN também deu a versão DS uma forma mais positiva [7.1 / 10].

GamesMaster revista no Reino Unido foi um pouco mais otimista em relação ao Xbox 360 encarnação, chamando-lhe "um jogo de ação agradável se descarte que pesa em um preço não tão descartável."IT Reviews reclamou que o jogo consistia em "ataques repetitivos de explodir os mesmos inimigos, através do mesmo terreno", e acrescentou "a maior parte do tempo ela se sente como se estivesse apenas a metade o jogo."

G4TV's Play deu ao jogo uma 05/01, dizendo: "GI Joe: The Rise of Cobra é o padrão ouro para preguiçosos e sem inspiração dinheiro em jogos licenciados. Talvez se possa argumentar que os desenvolvedores não tem muito para trabalhar com o dado material de origem, mas que não ajuda o consumidor infeliz que acaba preso com esse Junkyard Dog de um jogo em sua coleção. " Nexus Gaming comentou que "Não há nenhuma razão para comprar GI Joe, desde que haja pelo menos um outro jogo na prateleira da loja".

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