Um ano depois de Ninja Gaiden, mestre ferreiro Muramasa é a criação de loja em Tóquio. Um agente da CIA chamado Sônia entra no local e pede o paradeiro de Ryu Hayabusa, até membros do Black Spider Ninja Clan ataque a loja e seqüestrá-la. Enter the Dragon Ninja Ryu, que não consegue parar de seqüestro de Sônia e se apressa em torno do arranha-céus de Tóquio e resgata o agente, que lhe informa de um ataque à aldeia Hayabusa pelo Black Spider Ninjas, que deseja roubar a estátua do demónio que possuem e proteger.Ryu retorna para sua casa e encontra seu pai, Joe Hayabusa duelo com Genshin, líder do Black Spider Ninja Clan. Infelizmente, a Estátua Demon é levado pela Rainha dos Demônios Maior e Regente do Sangue, Elizébet, e Joe exorta seu filho para recuperar a estátua a todo custo. Ryu viaja pelo mundo com Sonia, em busca de Elizébet ea Estátua do Demônio, enquanto encontrando legiões de Black Spider Ninjas, Demônios, e outros três Greater Fiends: Alexei, o Governador Graciosos relâmpago; Volf, o Governador Invincible das Tormentas, e Zedonius, o Governador do Malevolent Flame.Ryu faixas Elizébet à América do Sul, onde ela oferece a Estátua Demon Infernal Sumo Sacerdote Dagra Dai, a fim de ressuscitar a antiga Archfiend, Vazdah. Elizébet duelos com Ryu e derrota-la, mas Elizébet anuncia seu retorno. Um Genshin vista explica que os demônios estão olhando para ressuscitar o Archfiend que é suposto a emergir do Monte Fuji no Japão para trás. A montanha é também o lugar que binded tanto o Black Spider Clan e The Dragon Lineage. Ryu retorna para casa, advertindo Sonia não segui-lo.Como Ryu tem vista para o fogo cheio Monte Fuji, Ayane entra com o Olho do Dragão, um presente de Joe Hayabusa e Ryu equipa a relíquia em sua Dragon Sword, formando a True Dragon Sword novamente. Indo para o cume da montanha, Ryu encontra Genshin esperando por ele na entrada da cratera.

Como o Monte Fuji entra em erupção, Genshin revela a Ryu que ele nunca se importou com "birras do satanás" e que seu momento chegou finalmente. os dois ninjas lutar até a morte. Genshin cai saltos mortos e Ryu em Monte Fuji. Elizébet aparece sobre um Genshin falecido olhando para reanimá-lo como um demônio como Ryu desce em Monte Fuji.Ryu luta contra hordas passado dos Demônios e singlehandedly derrotas Zedonius, Volf, e Alexei, e resgata um Sonia capturado. Ele instrui-la a ficar e não se mover. Ryu cabeça em outro quarto e encontra uma Genshin ressuscitado, transformado em um demônio, volta para uma quarta e última batalha. A batalha ninja dois em outra árdua batalha que terminou com Ryu Genshin de corte para baixo, mesmo dividindo sua armadura face fazê-lo. Genshin e Ryu, apesar de adversários mortais, partilham uma relação mútua final como o ninja no momento de morrer Genshin. partes Genshin com Ryu que todas as suas ações foram feitas para fortalecer o Black Spider Clan como um todo (ao longo de toda a sua causa) e não se arrepende de prosseguir esse. Ele reconhece Ryu como um grande guerreiro, e em apoio à causa de Ryu lhe dá a lâmina amaldiçoada do satanás para uso antes de morrer. A Elizébet aparece furioso, e castiga a Black Spider Ninja para perder, mesmo com seu poder. Ryu ataques Elizébet, e corta-lhe furiosamente até poeira vermelha com a combinação de sua própria espada de dragão e Lâmina Genshin é do satanás. Ele afirma que o soberano tinha mais para viver do que ela jamais o faria.Viajando mais no submundo, Ryu enfrenta Dagra Dai, que está quase concluído, com a ressurreição Archfiend, e derrota-o. Como último recurso, o Infernal Sumo Sacerdote oferece a sua vida para Vazdah eo Archfiend renasce.

Ryu toma conta da monstruosidade e vai para a superfície com Sonia, mas uma gota de seu sangue de uma ferida aberta acidentalmente derrama sobre o demônio e revitaliza Vazdah, que sobe ao cume em sua forma verdadeira. Em meio a uma erupção do Monte Fuji, praças Ryu fora com o Archfiend em um duelo climático para decidir o destino da humanidade e ganha. Sonia e Ryu reunir e subir ao topo da montanha, compartilhando o nascer do sol juntos.Em uma cena pós-créditos, entre um campo com o número incontável de lâminas incrustado no solo, plantas Ryu's Blade Genshin do Archfiend no chão e arcos em relação para o Aranha Negra Overlord. O Ninja Dragon tem uma última olhada antes de decolar em direção ao nevoeiro.A história é revista, em seguida, continuou com a série NES: Ninja Gaiden, Ninja Gaiden II: The Dark Sword of Chaos e Ninja Gaiden III: The Ancient Ship of Doom, possivelmente fazendo todos os jogos em uma única continuidade.

O sistema de Ninja Gaiden II é combater a nova permite Ryu a desmembrar seus inimigos, cortando seus membros e rasgando seus corpos separados cobrindo a sua arma e tudo ao redor com sangue. Em comparação com Ninja Gaiden, a sequela contém mais gore e violência gráfica. Desmembramento vai enfraquecer ou abrandar um inimigo, dependendo se um braço ou uma perna é cortada, mas não necessariamente matá-lo. Na verdade, um inimigo ferido estará propenso a usar táticas suicidas, como a pinagem Ryu baixo e plantar um shuriken incendiárias sobre ele, forçando o jogador a rapidamente acabar com seus oponentes, usando novas técnicas brutais Obliteration antes inimigos feridos pode chegar a mão superior. Essa nova mecânica também pode ser desencadeada na presença de vilões. Em comparação com outros títulos de ação e aventura, o jogador pode ser tão vulnerável a ataques como os inimigos podem lutar durante os encontros.Além de suas técnicas de combate corpo a corpo padrão, Ryu pode absorver a essência próximos em combate. Estes globos coloridos de energia são liberadas dos corpos dos inimigos mortos, e absorvido no corpo de Ryu quando ele chega perto deles. Essence tem um papel importante para o jogo em geral, na qualidade de curar Ryu, restaurar seu ki, ou aumentar o seu dinheiro. Entretanto, o jogador pode causar Ryu deliberadamente empate em essência, que pode então ser usado para desencadear ataques poderosos conhecido como Ultimate Techniques. Quando Ryu luta e sofre dano, há uma barra vermelha que começa a construir para a esquerda da barra de Ryu saúde, que é chamado de danos permanentes. Depois que Ryu tem abatido todos os seus inimigos nessa área em particular, recarrega a sua saúde, mas somente até o ponto onde começa a barra vermelha. Ervas da Vida Espiritual e as Estátuas Salvar posso curar esse dano, no entanto. Além disso, quando é feito Ryu lutando, ele realiza uma chiburui (o ato de golpear o sangue fora de sua arma). Ele faz isso para cada arma, com uma animação diferente para cada um. Ryu pode ficar parado e tentar bloquear os ataques (ainda que os inimigos podem quebrar sua guarda e deixá-lo vulnerável a ataques) ou ele pode iludir por arrojado afastado em uma manobra chamada "vento contrário". O jogo tem também dois elementos da atualização Pack furacão do jogo original: a rotação da câmera e da capacidade de carga acima de uma técnica de final sem a necessidade de essência (isto leva tempo para carregar; essência ainda pode ser absorvida para acelerar o processo).

Ryu vai usar sua assinatura Dragon Sword em combate, mas novas armas, como o Eclipse Scythe, a garra do Dragão e espadas Tiger Fang, Tonfa, Gama Kusari e as garras do falcão ninja Talons permitirá a variedade jogador mais no envio de inimigos. nova Ryu feitiços mágicos, sob a forma de Ninpo, inclui a arte do Phoenix Flame, Arte da pás eólicas, e a arte do Piercing Void. No entanto, armas e ninpo a partir do original de Ninja Gaiden irá retornar em forma de Arte do Inferno, Lunar Staff e Flail Vigorian. O retorno Moinho Shuriken, Incendiary Shurikens, e arco (Bane Renomeado do Demônio Arco), pode agora chamar de essências, como todas as armas de melee Ryu para cumprir as suas próprias Ultimate Technique.
Ninja Gaiden II foi recebido com críticas positivas. A maior parte do design gráfico e variedade de armas têm sido elogiadas. O jogo tem sido criticado por uma câmera inábil que dificulta o movimento do jogador, certos níveis que faltam recursos visuais adequados, de combate e uma framerate inconsistentes no modo 1080p com upscaling. A história tem sido criticado e descrito como absurdas, mas ao mesmo tempo, sem importância para o jogo como um todo, enquanto a dificuldade em níveis mais avançados também tem sido criticado por ser extremo e "barato". GameSpot é indicado para o prêmio de "Melhor Menos Sequel" em suas concessões 2008 video game.Em 28 de agosto de 2008, Ninja Gaiden II foi relatado como tendo vendido mais de um milhão de cópias.